对抗上古之神（黑暗之门二十五年）
在克苏恩被击败、联盟的叛乱被镇压、火刃氏族被消灭以后，艾泽拉斯的各方主要势力不约而同地认为，上古之神是一个必须立即被解决的威胁。
在诺森德，阿努巴拉克和他曾经的族人进行着持久的战争。蜘蛛们向下挖洞，挖到了尤格萨隆的触须，最终逐渐变成了古神的奴仆。
于是阿努巴拉克渐渐地发现，虽然蛛魔被击败了，但自己手下的地穴恶魔不是那些无面者的对手。于是，他请求女王陛下亲自出马来帮助他解决这个危机。
吉安娜派遣克尔苏加德先去探一探情况，收集一些情报，同时让凯尔萨斯指挥着纳克萨玛斯、他手下的银月议会以及其他高等精灵亡灵们，想办法消除冰巨魔和维库人的威胁，为天灾军团解决后顾之忧。
凯尔萨斯和克尔苏加德都很出色地完成了女王交给他们的任务。
凯尔萨斯率领着银月议会以及效忠于天灾军团的脚男们，成功地收服了维库人，并且一举捣毁了冰巨魔的老巢，把祖达克也纳入了天灾军团的版图。
克尔苏加德和他手下的冒险者们则意识到，尤格萨隆的牢笼已经不坚固了，这个怪物随时可能被释放，所以他们必须立即采取行动，否则就晚了。
看到了克尔苏加德的汇报以后，吉安娜决定亲自去解决这个问题。她潜入了奥杜尔，试图与守护者对话，接着便发现以洛肯为首的守护者已经遭到了腐蚀。
上古之神试图精神腐蚀吉安娜和她的手下，但由于他们都是亡灵天灾，这种精神攻击完全没有发挥任何作用。
天灾军团的脚男们在巫妖女王和一群巫妖们的带领下，激战在奥杜尔，最后终于击败了十几个boss，击败了尤格萨隆，还遭遇了观察者奥尔加隆。
吉安娜意识到如果不能阻止奥尔加隆，艾泽拉斯就会被毁灭、重塑。巫妖女王试图向联盟和龙族求援，但时间所剩无几，根本来不及了。
天灾企图在指定的时间内击败奥尔加隆，但巫妖女王却绝望地发现，奥尔加隆已经把讯息发出去了。最后，亡灵们终于打倒了观察者，但似乎一切都已经无可挽回......
在潘达利亚，暗夜精灵的冒险者们，以及四大天神积极地帮助周卓等熊猫人清楚了残余的煞，并且消灭了亚煞极的残余势力。
为了彻底地粉碎、击败亚煞极和他的煞，四大天神用尽了他们大部分的力量，最终几乎变成了没有实际意义的吉祥物。
祝踏岚掌门在战斗中遭到了阴险的老姜的被刺，含恨而死。后来新掌门老姜宣布要“继承掌门遗志”，“统一尚未成功，武僧仍需努力”。
季火掌，新和新的朋友们仍然呆在影踪派为老姜效力，但是他们已经注意到了潘达利亚政治风向的变化。新已经开始盘算着，要不要脱离影踪派单干。
新担心他和他的朋友迟早会遭到老姜的迫害。
在无尽之海上，暴风国的海军遭遇了娜迦的袭击，接着便引发了联盟和娜迦的全面战争。在沃金、祖尔金等巨魔的说服下，赞达拉的巨魔也加入了部落。
黄金舰队开始在萨尔大酋长的统一指挥下，帮助联盟一起对抗娜迦，因为这是“艾泽拉斯共同的威胁”。
此时，暗夜精灵的使者不情愿地向联盟透露了一些信息，告诉他们娜迦原来是他们的同胞，在第一口永恒之井被毁、天崩地裂之后才变成了怪物。
阿尔萨斯据此猜想娜迦的艾萨拉女王或许是一个可以被利用的对象，她应该不会心甘情愿地为古神工作。
联盟的情报机构开始满世界收集能够对付恩佐斯的神器，最后他们发现了艾泽拉斯之心和起源熔炉的相关信息。
穆拉丁和他的弟弟开怪狂魔布莱恩前往希利苏斯取得了艾泽拉斯之心。
联盟和部落的勇士们在瓦里安和沃金的带领下进入了尼奥罗萨。他们在这里和恩佐斯以及艾萨拉进行了一番激烈的战斗。
瓦里安想起了阿尔萨斯的话，故意把攻击的火力集中在恩佐斯及其仆从的身上，果然艾萨拉女王抓住机会跳反了，并使用萨拉塔斯摧毁了恩佐斯的外壳。
瓦里安指挥着联盟和部落的脚男使用艾泽拉斯之心和起源熔炉的力量粉碎了恩佐斯。
虽然艾萨拉恢复了自由，并且在最后时刻帮助了联盟和部落，但阿尔萨斯并不打算放过艾萨拉，他认为艾萨拉这样一个强大的存在，让她跑了无疑是放虎归山，他还说服了萨尔大酋长和他一起合作。
国王、大酋长率领50个脚男杀到此地，麦德安作为主力、罗宁作为指挥者，他们率领一大群法师反制了艾萨拉女王的传送术防止其逃走，最终在这里，众人齐心协力地消灭了艾萨拉女王。
艾泽拉斯的各方势力认为古神的灾难都被平息了。
但就在他们准备欢呼胜利的时候，巫妖女王却终于抓住联盟庆祝胜利的机会，找到了洛丹伦国王，告诉他艾泽拉斯马上就要完蛋了，唯一的办法就是赶紧修建各种掩体，并且把所有的人都转化成不吃不喝不呼吸的亡灵，只有这样他们才能在灾难中逃过一劫。
阿尔萨斯认为这只是吉安娜为了欺骗他自愿成为她的死亡骑士奴仆而编出来的鬼话。
巫妖女王则反复用她和他多年的感情以及曾经一起并肩战斗对抗死亡之翼和雷神的情谊向他保证，她说的都是真的，奥尔加隆发送了讯息，泰坦马上就会来重启秩序，艾泽拉斯真的要完蛋了。
阿尔萨斯希望吉安娜能够扔掉霜之哀伤和统御之盔，回到他身边来，但遭到了拒绝。
吉安娜“干一行爱一行”，尽管当初的她是走投无路被迫戴上统御之盔的，但如今她已经很享受当巫妖女王的感觉了。
再加上她已经成了一个亡灵，还和联盟的军队在潘达利亚发生过激烈的战斗，自认不可能再做洛丹伦的王后，便拒绝了阿尔萨斯的邀请。